Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN2O60636 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN2O60636 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms