Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PLXNC1O60486 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PLXNC1O60486 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PLXNC1O60486 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PLXNC1O60486 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms