Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN3BO60391 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN3BO60391 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms