Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG3O60359 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 595 ms