Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD5O60279 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms