Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMTOR5O43504 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms