Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRGAP3O43295 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms