Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD3O43242 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD3O43242 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD3O43242 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms