Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP8O43159 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRP8O43159 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP8O43159 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP8O43159 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP8O43159 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP8O43159 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP8O43159 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP8O43159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP8O43159 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP8O43159 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP8O43159 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP8O43159 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP8O43159 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP8O43159 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP8O43159 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP8O43159 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP8O43159 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP8O43159 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP8O43159 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP8O43159 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP8O43159 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP8O43159 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP8O43159 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP8O43159 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP8O43159 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP8O43159 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP8O43159 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP8O43159 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP8O43159 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP8O43159 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms