Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLDN3O15551 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN3O15551 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms