Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOX3O15254 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms