Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC3O15234 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC3O15234 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC3O15234 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC3O15234 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC3O15234 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC3O15234 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC3O15234 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC3O15234 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC3O15234 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC3O15234 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC3O15234 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC3O15234 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC3O15234 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC3O15234 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC3O15234 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms