Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNMO15061 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNMO15061 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SYNMO15061 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNMO15061 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNMO15061 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNMO15061 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNMO15061 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNMO15061 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNMO15061 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNMO15061 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNMO15061 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNMO15061 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNMO15061 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNMO15061 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNMO15061 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNMO15061 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
SYNMO15061 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNMO15061 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNMO15061 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNMO15061 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNMO15061 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNMO15061 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNMO15061 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNMO15061 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNMO15061 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNMO15061 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNMO15061 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNMO15061 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNMO15061 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNMO15061 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNMO15061 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNMO15061 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNMO15061 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNMO15061 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNMO15061 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNMO15061 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNMO15061 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNMO15061 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNMO15061 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNMO15061 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNMO15061 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNMO15061 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNMO15061 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNMO15061 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNMO15061 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNMO15061 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNMO15061 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNMO15061 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNMO15061 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNMO15061 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNMO15061 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNMO15061 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNMO15061 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNMO15061 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNMO15061 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNMO15061 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNMO15061 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNMO15061 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SYNMO15061 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNMO15061 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNMO15061 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms