Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7AO14910 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms