Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNPO2O14787 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNPO2O14787 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNPO2O14787 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms