Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VCYO14598 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VCYO14598 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VCYO14598 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VCYO14598 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VCYO14598 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCYO14598 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCYO14598 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCYO14598 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCYO14598 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCYO14598 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCYO14598 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms