Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TXNDC9O14530 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC9O14530 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms