Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CUX2O14529 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CUX2O14529 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CUX2O14529 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CUX2O14529 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CUX2O14529 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CUX2O14529 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CUX2O14529 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CUX2O14529 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CUX2O14529 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CUX2O14529 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CUX2O14529 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CUX2O14529 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CUX2O14529 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CUX2O14529 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CUX2O14529 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CUX2O14529 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CUX2O14529 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CUX2O14529 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CUX2O14529 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CUX2O14529 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CUX2O14529 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CUX2O14529 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CUX2O14529 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
CUX2O14529 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CUX2O14529 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CUX2O14529 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CUX2O14529 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CUX2O14529 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CUX2O14529 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CUX2O14529 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CUX2O14529 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CUX2O14529 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CUX2O14529 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CUX2O14529 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CUX2O14529 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CUX2O14529 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CUX2O14529 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CUX2O14529 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CUX2O14529 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CUX2O14529 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CUX2O14529 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
CUX2O14529 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CUX2O14529 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CUX2O14529 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CUX2O14529 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CUX2O14529 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
CUX2O14529 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CUX2O14529 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CUX2O14529 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CUX2O14529 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CUX2O14529 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CUX2O14529 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CUX2O14529 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CUX2O14529 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CUX2O14529 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CUX2O14529 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CUX2O14529 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CUX2O14529 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CUX2O14529 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
CUX2O14529 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CUX2O14529 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CUX2O14529 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CUX2O14529 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CUX2O14529 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CUX2O14529 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CUX2O14529 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CUX2O14529 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CUX2O14529 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CUX2O14529 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CUX2O14529 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CUX2O14529 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CUX2O14529 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CUX2O14529 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CUX2O14529 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CUX2O14529 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CUX2O14529 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CUX2O14529 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CUX2O14529 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CUX2O14529 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CUX2O14529 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CUX2O14529 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CUX2O14529 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CUX2O14529 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CUX2O14529 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms