Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHDO14521 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHDO14521 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHDO14521 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHDO14521 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHDO14521 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHDO14521 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHDO14521 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHDO14521 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHDO14521 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHDO14521 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHDO14521 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHDO14521 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHDO14521 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHDO14521 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHDO14521 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHDO14521 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHDO14521 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHDO14521 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHDO14521 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHDO14521 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHDO14521 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHDO14521 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHDO14521 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHDO14521 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHDO14521 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHDO14521 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHDO14521 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms