Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GFRA2O00451 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFRA2O00451 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms