Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4O00268 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4O00268 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4O00268 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4O00268 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4O00268 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF4O00268 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4O00268 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4O00268 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4O00268 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4O00268 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4O00268 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4O00268 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4O00268 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4O00268 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4O00268 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4O00268 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4O00268 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4O00268 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4O00268 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4O00268 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4O00268 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4O00268 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms