Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEN1O00255 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MEN1O00255 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEN1O00255 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEN1O00255 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEN1O00255 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEN1O00255 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEN1O00255 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEN1O00255 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEN1O00255 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEN1O00255 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEN1O00255 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEN1O00255 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEN1O00255 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEN1O00255 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEN1O00255 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEN1O00255 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEN1O00255 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEN1O00255 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEN1O00255 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEN1O00255 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEN1O00255 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEN1O00255 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEN1O00255 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEN1O00255 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEN1O00255 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms