Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARVCFO00192 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARVCFO00192 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARVCFO00192 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARVCFO00192 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms