Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms