Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8VP50 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8VP50 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8VP50 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8VP50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8VP50 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8VP50 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8VP50 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8VP50 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8VP50 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
F8VP50 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
F8VP50 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8VP50 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8VP50 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8VP50 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8VP50 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8VP50 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8VP50 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8VP50 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8VP50 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8VP50 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8VP50 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
F8VP50 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8VP50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8VP50 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8VP50 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8VP50 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
F8VP50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8VP50 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8VP50 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
F8VP50 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
F8VP50 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
F8VP50 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms