Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PBE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PBE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PBE3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PBE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PBE3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PBE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PBE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E9PBE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PBE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PBE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PBE3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PBE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PBE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PBE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PBE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PBE3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PBE3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PBE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PBE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PBE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PBE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PBE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PBE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PBE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PBE3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PBE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PBE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PBE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PBE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PBE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PBE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E9PBE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E9PBE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E9PBE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms