Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF487B1APH4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF487B1APH4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms