Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00587B1AMM8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00587B1AMM8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms