Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL13PA6NNM8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms