Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN8A6NHC0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms