Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMCO2A6NFE2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMCO2A6NFE2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMCO2A6NFE2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMCO2A6NFE2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms