Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA8A3KMH1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms