Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA6A0AVT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms