Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A8A0AV02 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A8A0AV02 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A8A0AV02 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms