Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCRBV5S2A0A599 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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