Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms