Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMKLBQ9ULI2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms