Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms