Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms