Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms