Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN3Q9P232 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms