Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCMF1Q9P0J7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms