Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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