Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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