Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms