Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms