Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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