Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190 ms