Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms