Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms